Dicat dengan warna merah, kata “VON” adalah semua yang tertinggal setelah serangan teroris di fasilitas nuklir di Jepang. Pemerintah hancur oleh ketidakmampuan mereka untuk bertindak, dan polisi dibiarkan dengan panik mencari cara untuk menindak para pelakunya. Publik tidak tahu apa-apa — sampai, enam bulan kemudian, sebuah video aneh muncul di internet. Di dalamnya, dua remaja laki-laki yang mengidentifikasi diri mereka sebagai “Sphinx” secara langsung menantang polisi, mengancam akan menyebabkan kehancuran dan kekacauan di seluruh Tokyo. Tidak dapat menghentikan kepanikan massal yang menyebar dengan cepat ke seluruh kota dan sangat membutuhkan petunjuk dalam penyelidikan mereka, polisi berjuang untuk bertindak efektif melawan teroris ini, dengan Detektif Kenjirou Shibazaki terjebak di tengah semua itu.

Zankyou no Terrormenceritakan kisah Sembilan dan Dua Belas, dua anak laki-laki di balik sosok Sphinx bertopeng. Mereka seharusnya tidak ada, namun mereka berdiri kokoh di dunia penipuan dan rahasia sementara mereka membuat kota runtuh di sekitar mereka, semua dengan harapan mengubur kebenaran tragis mereka sendiri.