Meskipun sudah setahun sejak Klub Renang SMA Iwatobi dibentuk, anggota baru masih belum bergabung dengan klub. Sekarang Haruka Nanase dan Makoto Tachibana adalah siswa senior, bersama dengan teman-teman mereka yang lebih muda Nagisa Hazuki dan Rei Ryuugazaki, mereka harus mencari cara untuk menarik anggota baru. Jika tidak, klub akan terpaksa tutup pada tahun berikutnya karena kurangnya keanggotaan.
Sementara itu, dengan kelulusan yang akan datang, ini juga merupakan waktu bagi para senior untuk memutuskan rencana masa depan mereka. Tidak seperti teman mereka Rin Matsuoka, kapten baru dari Klub Renang Akademi Samezuka yang bertekad untuk memenuhi mimpinya menjadi perenang profesional, Haruka dan Makoto tidak yakin tentang jalur karir apa yang ingin mereka ambil.
Masalah lebih lanjut muncul ketika seorang teman lama Rin, Sousuke Yamazaki, datang ke kota untuk belajar di Akademi Samezuka; Kedatangan perenang yang baru-baru ini dicari menyebabkan ketegangan dalam hubungan di antara dia, Rin, dan Haruka.