Bertualang ke hutan belantara, Ryouta Murakami yang skeptis dan Kuroneko yang ambisius sedang dalam upaya untuk membuktikan keberadaan kehidupan di luar bumi ketika kecelakaan tragis terjadi, menuai Kuroneko dari hidupnya dan meninggalkan Ryouta dalam keadaan terluka parah.
Sepuluh tahun telah berlalu sejak bencana tersebut, dan Ryouta sekarang menjalani kehidupan normal di sekolah menengah. Dia bersumpah untuk membuktikan bahwa alien itu nyata untuk menghormati almarhum temannya. Seorang murid pindahan bernama Neko Kuroha tiba-tiba tiba suatu hari, memiliki kemiripan yang mencolok dengan almarhum Kuroneko — bahkan memiliki nama yang mirip. Yang paling misterius, dia tampaknya memiliki kekuatan supernatural.
Saat Ryouta lebih tertarik pada Neko, dia ditarik ke dunia yang mematikan di mana para ilmuwan berbahaya berburu penyihir pengguna sihir yang melarikan diri dari laboratorium penelitian rahasia mereka. Neko adalah salah satu pelarian ini, tetapi ada banyak orang lain yang berada dalam situasi yang sama, dan terserah Ryouta untuk melindungi mereka dari calon penculik mereka.