Beberapa saat sebelum kelahiran Naruto Uzumaki, iblis besar yang dikenal sebagai Kyuubi, Rubah Ekor Sembilan, menyerang Konohagakure, Desa Daun Tersembunyi, dan membuat kekacauan. Untuk mengakhiri amukan Kyuubi, pemimpin desa, Hokage Keempat, mengorbankan hidupnya dan menyegel monster mengerikan di dalam tubuh Naruto yang baru lahir.
Sekarang, Naruto adalah ninja hiperaktif dan berkepala bulat yang masih tinggal di Konohagakure. Dijauhi karena Kyuubi di dalam dirinya, Naruto berjuang untuk menemukan tempatnya di desa, sementara keinginan membara untuk menjadi Hokage Konohagakure membawanya tidak hanya ke beberapa teman baru yang hebat, tetapi juga beberapa musuh yang mematikan.