The “Noblesse” Cadis Etrama di Raizel, juga dikenal sebagai “Rai,” terdaftar di Ye Ran High School oleh pelayannya Frankenstein untuk tetap tersembunyi dari pemandangan Union, sebuah organisasi misterius keluar untuk darah Rai. Rai memulai hidupnya sebagai seorang siswa, membuat dirinya akrab dengan teman-teman sekelasnya dan kegiatan sehari-hari manusia. Namun, kehidupan barunya jauh dari damai, dan Rai segera dipaksa untuk menyelamatkan teman-teman barunya dari tangan Union yang telah menculik mereka.
Sementara itu, M-21—seorang agen Union yang menjadi nakal selama operasi penyelamatan Rai—bergabung dengan staf keamanan SMA Ye Ran setelah mendapat tawaran dari direktur sekolah, yang kebetulan tidak lain adalah Frankenstein sendiri. Di permukaan, M-21 adalah karyawan yang sopan dan baik, tetapi sebenarnya dia dibelenggu oleh ikatan sebelumnya dengan Serikat dan konsekuensi tak terhindarkan dari pengkhianatan organisasi.
Untuk lebih memperumit masalah, Nobles Regis K. Landegre dan Seira J. Loyard mendaftar di sekolah yang sama untuk menyelidiki Noblesse. Sementara Union melakukan perburuan M-21 untuk mendapatkan petunjuk tentang agen mereka yang hilang, Rai terpaksa menyembunyikan identitasnya sambil melindungi semua yang dia sayangi.